En 1972, une élève de la classe de 3ème 3, Yomiyama Misaki, a trouvé la mort dans un mystérieux incendie. En plein déni, ses camarades de classes décidèrent d’agir comme si elle était toujours parmi eux et ceci, jusqu’à la fin du lycée.

En 1998, un jeune garçon du nom de Kôichi Sakakibara, est transféré en 3ème 3 dans ce même établissement. Dans cette classe, il y découvre une atmosphère tendue ainsi qu'un étrange comportement provenant de ses nouveaux camarades de classe, qui semblent cacher de terribles secrets. L'un d'eux, est l'ignorance totale envers une élève, une étrange brune au cache œil : Meï Misaki.